伊朗与以色列的“灭国之战”即将爆发，美国反对暗杀伊朗最高领袖哈梅内伊。伊朗将对以色列进行报复，同时伊朗也将对以总理内塔尼亚胡的家庭住所进行袭击。面对暗杀指控，伊朗声称已采取防备措施，但以色列成功暗杀9名与核项目相关的伊朗科学家。

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于是，导演庵野秀明在筹集到足够预算后，重新制作了该系列，对电视动画版进行重新剪辑和补充，完成了《新世纪福音战士剧场版：死与新生》（EVANGELION:DEATH&REBIRTH）：其中“DEATH”部分对应…